Proste ,wrywasz nie podałeś jaki rom - pewnie ICS stock w flashtollu z funkcja bez WIP - system wtedy sie wgra z nadpisaniem tylko swoich systemowych plików i z zachowaniem wszystkiego tak jak było - ustawień itp. Co do zmiany romów to Albo wgrywasz na czysto i sobie ustawiasz i przywracasz savy itp rećznie albo używasz np titanium Backup i kopi sdcard i masz po staremu .
Następnie polecam na przyszłość np na Costum romach masz funkcje backup systemu i ręcznie backup sdcard i wrazie problemu możesz szybko wgrać kopie zapasową i jak nie naruszony .
Sam mam z orange polecam metode testpoint banalnie prosta i flash zmininego kenrela na ftf - przeróbka 5s i wgranie np Cm11 czy Cm13 romu - o wiele wydajniejsze i uzyteczne romy