No więc zacznijmy od początku.
Android - System operacyjny przeznaczony głównie dla urządzeń dotykowych (smartfony, tablety, netbooki). Występują różne wersje Androida które niosą za sobą listę zmian, o której możesz dowiedzieć się na na tej stronie oraz o samym Androidzie na wikipedii .
Dalej piszesz o rodzajach Androida, tak naprawdę rodzaje tego systemu bardziej określa się po jego wersjach tj. numerach (np. 2.3.4, 4.0.4, 4.3 itd.). Każda wersja niesie ze sobą zmiany i usprawnienia systemu.
Kolejnymi pojęciami, które wymieniasz to CyanogenMod i MIUI , są to specjalne "wersje Androida", które różnią się od podstawowych systemów w telefonach większą ilością usprawnień (więcej opcji dotyczących zachowań telefonu, zmiany interfejsu). Systemy te są robione przez niezależnych developerów na różne urządzenia. Zwykle są "lepsze" od podstawowych OS'ów w smartfonach. Dlaczego lepsze? Dlatego, iż CyanogenMod charakteryzuje się znacznie płynniejszym interfejsem, mnogością nowych ustawień, jeśli chodzi o MIUI jest bardziej kolorowe i wyglądem faktycznie przypomina IOS. Android jest systemem, którego kod źródłowy jest udostępniany publicznie dlatego ludzie, którzy są bardziej ogarnięci wykorzystując go tworzą własne wersje tego systemu, ale opierają się na tym samym podstawowym kodzie, tak powstają Custom ROMy, a więc np. systemy wspomniane kilka zdań wyżej. Wspominasz jeszcze o SENSE, jest to nakładka interfejsu Androida, która występuje w telefonach firmy HTC. Kolejnymi przykładami takich nakładek może być TouchWiz występujący w Samsungach i LG UI u LG. Nakładki te odróżniają od siebie różne marki, jednak nie mają żadnego znaczenia w dostosowaniu do nich aplikacji. Mają wpływ na wydajność, ponieważ niektóre są bardziej wymagające niż drugie.
Kolejnie piszesz, że denerwują Cię aplikacje, które nie są tobie potrzebne i chciałbyś się ich pozbyć przez instalację innego systemu. Tak naprawdę nie musisz tego robić aby się ich pozbyć. Są to aplikacje systemowe, które producent chciał Ci wcisnąć i owszem w zwykły sposób ich nie usuniesz. Do ich skasowania wymagany jest ROOT, a więc przerobienie telefonu abyś z poziomu systemu miał dostęp do uprawnień administratora systemu (uprawnień ROOTa). Mając już takie uprawnienia możesz usunąć i zmienić w system prawie wszystko. Należy pamiętać, że wgranie ROOTa wiąże się ze stratą gwarancji na urządzenie.
Ostatnią już kwestią będzie instalacja nowego systemu. Masz do wyboru dwa rodzaje systemów Custom ROM i oryginalny ROM od producenta. Definicję pierwszego z nich przedstawiłem wyżej, drugi to standardowy system od producenta telefonu. Oprogramowanie oficjalne możesz wgrać przy użyciu odpowiedniego programu udostępnianego od producenta (dla HTC nie wiem jak się on nazywa), powinieneś móc go znaleźć na stronie producenta. Co do Custom ROMów jest trochę inaczej. Zwykle są one zawierane w paczkach .zip i instalowane z poziomu Recovery.
Na koniec odeślę Cię jeszcze do https://forum.android.com.pl/topic/14130-jestea-nowym-ua-ytkownikiem-androida-zobacz-koniecznie-android-faq/ tematu na tym forum, który dokładniej precyzuje pojęcia związane z Androidem jest swego rodzaju kompendium wymaganej wiedzy dotyczącej tego systemu. Natomiast Forum po zmianach, link nie działa znajdziesz więcej informacji, które dotyczą konkretnie twojego telefonu.
Jak będziesz miał jeszcze jakieś pytania, niejasności to pisz śmiało.😉