Ja zrobiłem kopię systemu w Titanium Backup i wykonałem Przywracanie ustawień fabrycznych z poziomu menu. Następnie przywróciłem brakujące aplikacje i ustawienia systemowe przy pomocy TB. Problem był z widgetami, trzeba było ręcznie zainstalować, ale TB od zawsze ma problem z przywracaniem widgetów.
Tak na dobrą sprawę nie jestem pewien co spowodowało ten błąd, bo okienka poznikały, ale ustawienia synchronizacji zostały.
Podejrzany jest też najnowszy Triangle Away, bo zachowywał się dziwnie. Nie chciał zerować licznika, a usuwał mi dostęp do recovery (podczas kombinacji przycisków vol. up+power następował reboot). Po zainstalowaniu CWM PhilZ dostęp do recovery wrócił, ale być może wtedy znikły okienka ustawień synchronizacji.
W każdym razie obecnie do roota używam Kingo Android ROOT (nie nabija licznika i podobno nie zmienia flagi KNOX- nie sprawdzałem osobiście).