Aplikacje przeniesione standardową metodą app2sd z FroYo są w folderze .androidsecure.
A cała reszta folderów na karcie pamięci, które tworzą programy... No niestety z tym nic nie zrobisz. Programy dobrze napisane wrzucają swoje dane do /Android/data, albo do samego /data, a reszta sobie tworzy foldery na głównej karcie pamięci. I generalnie trzeba to potem ręcznie usuwać po wyrzuceniu programu.
Plus tego jest taki, że praktycznie nie musisz używać menedżera plików, bo programy do przeglądania zdjęć same lokalizują obrazki, programy do muzyki tak samo, do pdf'ów również, tak więc zostaje menedżer plików tylko do instalowania .apk z karty pamięci 😛