Sterowniki do obsługi systemu plików są skompilowane z jądrem, dołączane jako moduły jądra lub działają w przestrzeni użytkownika (w FUSE).
Nie wiem czy Android implementuje FUSE dla sterownika do obsługi NTFS i exFAT. W przypadku NTFS przyjęło się używać go w przestrzeni użytkownika (ze względu na ntfs-3g), chociaż w głównej gałęzi kernela są sterowniki do NTFS. exFAT to niestety nadal nowość, choć obecnie sterownik pozwala na podstawowe operacje (odczyt, zapis i kilka operacji na systemie plików).
Jeżeli posiadasz zmodyfikowany system, to dla dużych plików znakomicie nadawałby się któryś z Linuxowych systemów plików czy btrfs. Niestety dla systemu Android nie ma w zwyczaju montować taki system plików jako system dla "karty pamięci", a pewnie wież że wingroza nie toleruje niczego innego poza pochodnymi FATa i NTFS.
Nie polecam żadnego z tych dwóch systemów plików, gdyż to nie są w pełni natywnie obsługiwane.
Co dotyczy sterownika który doinstalowałeś. Możliwe że ten sterownik także działa w przestrzeni użytkownika. Możliwe także że podobnie jak ntfs-3g może obsługiwać tylko jeden wątek procesora i to w dodatku go intensywnie używając przy operacjach z systemem plików NTFS, zwłaszcza z zapisem.