Wydaje mi się, że Skype nie potrafi obsłużyć wbudowanego mikrofonu. Przypuszczam, że konstrukcje telefonów różnych producentów/modeli różnią się i trudno było programistom obsłużyć tyle różnych konstrukcji, a wejście mikrofonowe z zestawu słuchawkowego jest ustandaryzowane. Być może chodzi też o brak full-duplexu przy użyciu wbudowanego mikrofonu. Problem ten jest również spotykany w programach do rejestrowania rozmów - programiści nie znaleźli sposobu na nagrywanie dźwięku ze słuchawki i mikrofonu jednocześnie.
W każdym razie jest to problem sprzętowy, nie do przeskoczenia.