Po poprawnej instalacji SuperSU wszystko powinno działać od razu. Jak masz ikonę SuperSU w menu, to wejdź do sklepu Play i zaktualizuj SU (powinna być aktualizacja). Po aktualizacji odpal SuperSU i powinienwyskoczyć monit o aktualizację binary su. Wybierz aktualizcję, metodę - "normalnie" i po chwili będzie po wszystkim.
Tym CCleaner się nie przejmuj - ten komunikat oznacza że CCleaner nie ma dostępu do root'a a nie że nie masz root'a w ogóle 🙂