U mnie 1 występuje prawie przy wszystkich aplikacjach, które są zapisane w data/app. Jak aplikacja jest przekonwertowana na aplikację systemową, znajduje się w system/app, 1 nie występuje. U siebie odinstalowałem link2sd, potem zainstalowałem najnowsza wersję i przemieniłem ją na aplikację systemową. Wszystko dobrze chodzi.
Można spokojnie przenosić aplikacje do system/app. Zyskuje się dzięki temu miejsce, a po przywróceniu telefonu do ustawień fabrycznych, nie będzie trzeba na nowo instalować aplikacji.