Z wątku nie będącego głównym wątkiem aplikacji nie można zarządzać activities
Co rozumiesz przez "zarządzanie activities"? Można startować inne activity, wołać finish(), itp.
NIE WOLNO natomiast odwoływać się do żadnych elementów UI (widgety). Np jak spróbujesz ustawić tekst na TextView, albo przeładować zawartość Adaptera, itp, to otrzymasz wyjątek i ładny opis błędu (że próbujesz to zrobić z innego niż UI wątku).
Generalnie jak najczęściej należy unikać tworzenia wątków.
Wątki należy tworzyć i używać tak często jak to jest możliwe aby nie uruchamiać czasochłonnych operacji w wątku głównym (UI) -> wtedy można zaliczyć ANR (Application Not Responding). Oczywiście należy ich używać z głową.
W celu uproszczenia pracy z wątkami jak napisał "rzabcio" najlepiej stosować klasę AsyncTask.
Cały czas należy jednak pamiętać o tym że po uruchomieniu wątku (albo po uruchomieniu AsyncTask'a), gdy on sobie pracuje, może się zdarzyć (a zdarza się np przy naciśnięciu przycisku BACK, przy obróceniu ekranu, ale także bez naszej wiedzy w innych przypadkach) że Activity zostanie zniszczone. Wtedy nawet AsyncTask nie pomoże i będzie crash, jeśli próbuje się np w metodzie onPostExecute() odwoływać do zniszczonego activity lub elementów UI z tego activity).