System operacyjny nie ma żadnego znaczenia.
To płyta główna, a właściwie BIOS oraz karta sieciowa muszą mieć obsługę WoL, którą trzeba włączyć (właśnie w BIOSIE). Następnie wystarczy wysłać pakiet "Magic Packet" na adres MAC karty sieciowej komputera, który chcemy obudzić.
Na Wiki jest całkiem zgrabny opis.
A co do aplikacji na andka... po wpisaniu "wake on lan" na markecie można znaleźć całkiem sporo programów i jestem pewny że 90% zadziała poprawnie, reszta to wybór interface'u który odpowiada nam najbardziej 🙂